文献类型：会议论文

中文题名：基于高通量测序的多鳞鱚性别相关功能基因挖掘

作者：田昌绪[1];李智渊[1];黄洋[1];陈华谱[1];杜涛[1];朱春华[1];李广丽[1];

机构：[1]广东海洋大学水产学院,广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心,湛江,524088,中国;

会议论文集：2018年中国水产学会水产生物技术专业委员会第九届学术研讨会暨水产生物技术与绿色发展学术研讨会论文集

会议日期：20181015

会议地点：广州

主办单位：中国水产学会

语种：中文

中文关键词：多鳞鱚;基因组;转录组;分子标记;功能基因

中文摘要：多鳞鱚Sillago sihama(Forsk(a)l),又名沙锥鱼,是我国沿海重要经济鱼类.目前,有关该物种研究多集中于渔业资源调查、人工繁殖、食性及群体遗传学等方面,而有关多鳞鱚基因组及其转录组学相关研究尚属空白.本研究利用高通量测序技术,首次在多鳞鱚雌、雄个体中开展了基因组Survey测序分析和性腺转录组学分析.1)、采用kmer17进行Survey分析,结果显示雌性多鳞鱚基因组大小为560.26 Mb,杂合率为0.69%,重复序列比例占 24.65％,scaffold N50 为 3,852 bp;雄性多鳞鱚基因组大小为558.28 Mb,杂合率为0.69％,重复序列比例为24.4％,scaffold N50 为 3,914 bp.