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- 9种石斑鱼遗传多样性和系统发生关系的微卫星分析
- 《遗传》董秋芬 刘楚吾 郭昱嵩 刘丽 吴勇 出版年:2007
- 利用实验室克隆的13个青石斑鱼微卫星分子标记,对中国南海海域9种石斑鱼(青石斑鱼、蜂巢石斑鱼、鲑点石斑鱼、黑边石斑鱼、鞍带石斑鱼、赤点石斑鱼、七带石斑鱼、斜带石斑鱼和棕点石斑鱼)进行了遗传多样性和系统发生关系的分析。研究...
- 关键词:石斑鱼 微卫星标记 遗传多样性 系统发生关系 被引量:58
- 青石斑鱼微卫星DNA标记的筛选及群体遗传多样性分析
- 《中国水产科学》刘丽 刘楚吾 郭昱嵩 董秋芬 徐田军 出版年:2008
- 以中国南海海域青石斑鱼(Epinephelus awoara)为材料,构建青石斑鱼小片段部分基因组DNA文库。以M13通用引物和设计合成的微卫星核心序列引物(CA)15,用PCR法对文库进行筛选,共获得96个微卫星序列,...
- 关键词:青石斑鱼 基因组文库 PCR法 微卫星标记 遗传多样性 被引量:32
- 5种笛鲷mtDNA及Cytb基因片段的RFLP比较
- 《水产学报》王中铎 刘楚吾 郭昱嵩 出版年:2005
- 采用线粒体DNA限制性片段长度多态性分析(mtDNARFLP)和线粒体DNA的细胞色素b基因(Cytb)的部分序列扩增限制性片段长度多态性分析(mtDNAPCRRFLP)两种方法,对笛鲷属5种鱼类进行种间系统发育的比较研...
- 关键词:笛鲷属 线粒体DNA限制性片段长度多态性分析 PCR-RFLP 系统发生 细胞色素b 假基因 被引量:19
- 三种笛鲷的野生群体和养殖群体遗传多样性的微卫星分析
- 《农业生物技术学报》彭银辉 刘楚吾 郭昱嵩 刘丽 王中铎 出版年:2008
- 利用微卫星标记技术,采用10对微卫星引物对南海海域红鳍笛鲷(Lutjanus erythopters)、星点笛鲷(L.stellatus)和紫红笛鲷(L.argentimaculatus)3种笛鲷鱼的野生种群(HYE、X...
- 关键词:笛鲷 养殖群体 野生群体 微卫星 遗传多样性 被引量:16
- 笛鲷鱼类的线粒体DNA控制区结构及其系统发育分析
- 《海洋学报》谭围 郭昱嵩 王中铎 刘楚吾 刘丽 出版年:2010
- 采用PCR扩增直接测序的方法获得了11种笛鲷鱼类的线粒体DNA控制区全序列。结合从GenBank中下载的6种笛鲷鱼类的相应序列进行结构分析,可以将笛鲷鱼类的控制区分为终止序列区、中央保守区和保守序列区三个区域,找到了终止...
- 关键词:笛鲷 线粒体DNA 控制区 系统发育 被引量:13
- 笛鲷属(Lutjanus)鱼类线粒体16S rRNA基因序列比较及系统学分析
- 《海洋与湖沼》刘楚吾 徐田军 刘丽 郭昱嵩 董秋芬 出版年:2009
- 对笛鲷属9种鱼的线粒体DNA16S rRNA基因片段进行了PCR扩增,扩增产物经纯化后测序,得到了长度为561bp的分析序列。结合GenBank中的另外9种笛鲷的16S rRNA同源序列计算得出A、T、G、C的含量平均为...
- 关键词:笛鲷属 16S rRNA 序列比较 分子系统学 被引量:12
- 利用微卫星分析吉富罗非鱼群体的遗传多样性
- 《南方农业学报》刘海情 郭昱嵩 王中铎 刘丽 刘楚吾 出版年:2012
- 【目的】为吉富罗非鱼种质资源的保护、评价以及育种提供理论依据。【方法】利用微卫星分子标记技术分析广东省化州光辉养殖场有限公司新选育的吉富罗非鱼第16代群体(F16)的遗传多样性。【结果】筛选出的8个微卫星位点在吉富罗非鱼...
- 关键词:吉富罗非鱼 微卫星标记 遗传多样性 等位基因 杂合度 被引量:11
- 南海大眼金枪鱼和黄鳍金枪鱼的群体遗传结构
- 《水产学报》王中铎 郭昱嵩 颜云榕 侯刚 范艳波 冯波 卢伙胜 刘楚吾 出版年:2012
- 测定了南海西沙和南沙群岛附近海区(11~12°N,15°N;110~112°E)黄鳍金枪鱼61尾(17尾成鱼、44尾幼鱼)和大眼金枪鱼26尾(22尾成鱼、4尾幼鱼)的线粒体基因组控制区部分序列(D-loop),结合Gen...
- 关键词:大眼金枪鱼 黄鳍金枪鱼 群体遗传 线粒体基因组控制区 被引量:10
- COI条形码辅助分析雷州半岛红树林区鱼类的物种多样性
- 《海洋与湖沼》张顺 廖健 柏琴 陈冲 郭昱嵩 刘楚吾 王中铎 出版年:2016
- 于2014年3月至2015年7月从我国雷州半岛红树林区采集成鱼和幼鱼样本共1720尾,在依据Fish Base等鱼类形态分类系统进行鉴定的基础上,利用COⅠ条形码技术确认存在94个物种,分属11目33科72属。结果表明:...
- 关键词:红树林 COI基因 DNA条形码 鱼类鉴定 物种多样性 被引量:10
- 青石斑鱼微卫星标记的筛选及群体多态性分析
- 《水产学报》董秋芬 刘楚吾 郭昱嵩 刘丽 徐田军 出版年:2007
- 微卫星DNA,又称短串联重复序列(STR)或简单序列重复(SSR),是广泛存在于真核生物基因组中的简单重复DNA片段,一般每个重复单位仅1~6个碱基,重复数为10~20次,其中动物体中以双核苷酸(CA/GT)n最为常见。...
- 关键词:青石斑鱼 基因组文库 PCR法 微卫星标记 遗传多样性 被引量:10
- 中国龙虾微卫星标记的筛选及遗传多样性分析
- 《遗传》刘楚吾 黎锦明 刘丽 郭昱嵩 出版年:2010
- 文章以M13通用引物和重复序列(CT)15、(AT)15引物,利用PCR法对中国龙虾(Panulirus stimpsoni Hoehuis)部分基因组DNA文库进行筛选。共获得78个微卫星序列,分别分布于55个阳性重组...
- 关键词:中国龙虾 基因组文库 微卫星标记 遗传多样性 引物筛选 被引量:10
- 湖栖鳍虾虎鱼性腺转录组比较分析
- 《水产学报》董忠典 黎学友 黄承勤 张海瑞 黄顺楷 张宁 郭昱嵩 王中铎 出版年:2021
- 为获得湖栖鳍虾虎鱼性腺基因表达谱,筛选性别决定、配子发生和繁殖相关基因,实验对其卵巢和精巢分别进行了RNA-Seq分析。测序原始数据经de novo拼接组装共获得62573个单基因(unigene),N50和平均长度分别...
- 关键词:湖栖鳍虾虎鱼 RNA-Seq 配子发生 繁殖 被引量:9
- 9种常见笛鲷微卫星位点筛选与遗传多样性分析
- 《热带海洋学报》郭昱嵩 王中铎 刘楚吾 陈志明 刘筠 出版年:2010
- 利用从勒氏笛鲷Lutjanus russelli基因组文库中筛选得到37对微卫星引物对笛鲷属9个习见种红鳍笛鲷L.erythropterus、紫红笛鲷L.argentimaculatus、星点笛鲷L.stellatus、...
- 关键词:笛鲷属(Lutjanus) 微卫星DNA 遗传多样性 被引量:8
- 北部湾皮氏叫姑鱼的遗传多样性分析
- 《南方农业学报》谢子强 刘雪媚 郭昱嵩 刘楚吾 出版年:2013
- 【目的】分析北部湾两个野生皮氏叫姑鱼的群体遗传多样性和遗传结构,为其种质资源的合理开发利用提供参考依据。【方法】利用已开发的皮氏叫姑鱼微卫星标记对北部湾临高县西海域(N20°20',E109°40)'和乐东县西海域(N1...
- 关键词:皮氏叫姑鱼 微卫星 遗传多样性 等位基因 杂合度 多态信息含量 北部湾 被引量:8
- 笛鲷属线粒体基因组编码序列的系统进化分析能力评估
- 《水产学报》王中铎 谭围 郭昱嵩 刘丽 刘楚吾 刘筠 出版年:2010
- 运用通用引物长距PCR(Long-PCR)和常规PCR相结合的方法测定了鲈形目笛鲷科的4种笛鲷属鱼类(孟加拉笛鲷、四带笛鲷、千年笛鲷和马拉巴笛鲷)和军曹鱼科的军曹鱼线粒体DNA基因组全序列(GenBank序列号分别为FJ...
- 关键词:笛鲷属 线粒体基因组 分子系统进化 被引量:8
- 孟加拉笛鲷线粒体基因组序列结构及其进化
- 《中国生物化学与分子生物学报》谭围 王中铎 郭昱嵩 刘楚吾 刘筠 出版年:2009
- 采用Long-PCR扩增线粒体全基因组方法得到了孟加拉笛鲷线粒体基因组全序列.序列分析结果表明,孟加拉笛鲷线粒体基因组序列全长16511bp,共有13个编码蛋白质基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个D-loo...
- 关键词:孟加拉笛鲷 线粒体基因组 系统发生 被引量:8
- 基于COI基因和D-loop区部分序列比较雷州半岛东、西岸湖栖鳍虾虎鱼群体的遗传多样性
- 《海洋科学》廖健 龙水生 贺亮 郭昱嵩 刘楚吾 刘丽 王中铎 出版年:2017
- 为比较分析雷州半岛东、西两岸湖栖鳍虾虎鱼(Gobiopterus lacustris)遗传差异,以COI基因和D-loop区部分序列为分子标记,获取雷州半岛湖栖鳍虾虎鱼群体COI序列44条(九龙山群体21条,高桥群体23...
- 关键词:COI D-loop 湖栖鳍虾虎鱼(Gobiopterus lacustris) 雷州半岛群体 遗传分化 被引量:7
- 北部湾光裸星虫3个地理群体遗传多样性
- 《中国水产科学》郭昱嵩 王庆恒 黎幸连 张立飞 杜晓东 出版年:2012
- 利用微卫星DNA分子标记对广东湛江乌石(ZJ)、广西北海山口(BH)与越南锦普(JP)3个光裸星虫(Sipunculus nudus)野生群体的遗传多样性进行分析。结果表明,20个微卫星座位中有3个位点(Snu08、Sn...
- 关键词:北部湾 光裸星虫 微卫星 遗传多样性 被引量:7
- 雌、雄弓背青鳉(Oryzias curvinotus)肝脏转录组比较分析
- 《海洋与湖沼》董忠典 黎学友 廖健 张宁 郭昱嵩 王中铎 出版年:2020
- 为发掘弓背青鳉(Oryzias curvinotus)肝脏功能基因、开发环境检测标记基因,本研究采用RNA-Seq技术分别测定了性成熟雌、雄弓背青鳉肝脏转录组,并获得80095044和87043984条clean rea...
- 关键词:弓背青鳉 肝脏 转录组测序 差异基因 生物标志物 被引量:7
- 湖栖鳍虾虎鱼皮肤和眼睛转录组比较
- 《水产学报》黎学友 谢明花 黄承勤 汪淳 王中铎 郭昱嵩 董忠典 出版年:2021
- 为了对湖栖鳍虾虎鱼的皮肤和眼睛进行转录组比较分析,实验通过测序原始数据,经de novo拼接、组装共获得103686个单基因(unigene),N50和平均长度分别为1456和2490 bp。在Nr、Nt、KO、Swis...
- 关键词:湖栖鳍虾虎鱼 皮肤 眼睛 RNA-Seq 色素形成 体色 被引量:7
- 笛鲷属鱼类DNA分子条码、系统进化和成种机制
- 《中国科学:生命科学》王中铎 郭昱嵩 李路 汤恩浦 谭围 刘楚吾 刘筠 出版年:2010
- 对20种笛鲷鱼类的72条DNA条码进行聚类分析,筛选出采自南海的13种笛鲷鱼类的典型样本;利用这13个典型样本的线粒体DNA的3个基因(COⅠ,COⅡ和Cytb)全序列和核DNA的2个基因(RAG1和RAG2)的部分序列...
- 关键词:系统进化关系 笛鲷属 物种形成 DNA条码 被引量:7
- 基于RAPD的SCAR分子标记技术鉴定虎纹蛙及引进种
- 《海洋湖沼通报》刘丽 刘楚吾 郭昱嵩 汤恩埔 彭向文 出版年:2008
- 为了对引进种泰国虎纹蛙加强种质监测,本文对泰国虎纹蛙和中国虎纹蛙进行了SCAR标记研究。在对2种蛙随机扩增多态DNA(RAPD)标记研究的基础上,选用随机引物OPP5和OPZ19对2种蛙进行扩增,将2个特异性扩增片段OP...
- 关键词:泰国虎纹蛙 中国虎纹蛙 RAPD SCAR 被引量:6
- 多鳞鱚(Sillago sihama)4个野生地理群体的微卫星标记分析
- 《海洋与湖沼》郭昱嵩 颜程钟 张宇岚 郑近楠 许远民 杜涛 王中铎 刘楚吾 出版年:2013
- 采用微卫星DNA分子标记方法对中国南部沿海多鳞鱚(Sillago sihama)广西北海、广东湛江、汕尾及海南三亚4个野生地理群体进行了遗传多样性及遗传分化等研究。结果表明:(1)用于研究的34对微卫星引物在4个群体中具...
- 关键词:多鳞[鱼]喜 微卫星DNA 遗传多样性 遗传分化 被引量:6
- 蛇鳄龟微卫星标记的开发及一个养殖群体的遗传多样性分析
- 《水生生物学报》刘丽 刘海情 郭昱嵩 王中铎 刘楚吾 出版年:2013
- 利用磁珠富集法,以生物素标记的(CA)15为探针,构建了蛇鳄龟(Chelydra serpentina L.)微卫星富集文库。通过PCR法从富集文库中共筛选出70条微卫星序列,一共设计了48对微卫星引物,采用PCR扩增的...
- 关键词:蛇鳄龟 微卫星标记 磁珠富集法 遗传多样性 被引量:5
- 鱼类视蛋白的研究进展
- 《海洋与湖沼》刘楚吾 余娟 王中铎 郭昱嵩 出版年:2015
- 鱼类作为脊椎动物最重要的类群之一,在其生长发育和进化中,视蛋白在视觉图像形成和生物钟昼夜节律等非图像形成功能调节方面起着至关重要的作用,根据其是否直接参与视觉成像分视觉视蛋白和非视觉视蛋白两大类。本文对国内外鱼类视蛋白生...
- 关键词:鱼类 视觉 非视觉 视蛋白 被引量:5
- 利用FIASCO技术进行波纹巴非蛤微卫星DNA标记分离与筛选的研究
- 《中国农学通报》郭昱嵩 谢子强 邓岳文 刘楚吾 出版年:2012
- 为揭示波纹巴非蛤种质遗传特性、开发种质库,利用FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing Repeats)技术开展了其基因组微卫星标记的分离与筛选研究。基因...
- 关键词:波纹巴非蛤 微卫星DNA 磁珠富集 遗传多样性 被引量:5
- 全基因组重测序筛选弓背青鳉三亚群体性别遗传标记
- 《广东海洋大学学报》王中铎 何传猛 姚泽彬 李金蓬 陈子阳 邓爱萍 赖卓欣 李银芳 董忠典 郭昱嵩 出版年:2023
- 【目的】开发弓背青鳉(Oryzias curvinotus)三亚群体(下称“三亚青鳉”)遗传性别鉴定分子标记,为进一步挖掘其性别决定基因奠定基础。【方法】用染色体商(Chromosome quotient,CQ)法比较雌...
- 关键词:弓背青鳉 三亚群体 性别特异性标记 重测序 染色体商区域 自然性别比 被引量:4
- 湖栖鳍虾虎鱼微卫星DNA标记的开发与群体遗传多样性分析
- 《动物学杂志》黄承勤 黄英毅 黄欣 王中铎 郭昱嵩 出版年:2020
- 为研究雷州半岛湖栖鳍虾虎鱼(Gobiopterus lacustris)遗传多样性,对湖栖鳍虾虎鱼雌雄性腺进行转录组测序,采用MISA软件进行微卫星分析,共获得25 452个微卫星标记,其中包含14 708个单碱基重复类...
- 关键词:湖栖鳍虾虎鱼 地理群体 微卫星DNA 遗传多样性 被引量:4
- 红鳍笛鲷皮肤色素细胞组成、分布及类胡萝卜素含量分析
- 《广东海洋大学学报》许振民 陈子钊 崔海涛 王中铎 郭昱嵩 出版年:2023
- 【目的】揭示红鳍笛鲷(Lutjanus erythropterus)红体色的分布特征及影响机制。【方法】利用色差仪分别测定背部、腹部和尾部皮肤的体色值,用形态学观察、石蜡切片、冰冻切片和透射电镜切片等方法分析色素细胞组成...
- 关键词:红鳍笛鲷 色素细胞 组织切片 类胡萝卜素 被引量:3
- 军曹鱼线粒体DNA全序列与鲹鱼宗系的系统进化
- 《水生生物学报》王中铎 郭昱嵩 刘楚吾 刘筠 出版年:2011
- 通过长距PCR法测得军曹鱼(Rachycentron canadum)全长16758 bp的mtDNA基因组全序列(GenBank登录号:FJ154956和NC_011219),结构组成与其他硬骨鱼类基本一致。Blast...
- 关键词:军曹鱼 线粒体DNA 系统进化 鲹鱼宗系 被引量:3
